在这我以QQ为例，其他的应该都差不多，需要工具如下：
Notepad++
Java
反编译软件apktool（百度下载有时间补上），还需要下载apktool-1.0.0和apktool-install-windows-2.1把里面东西放到到C:\\Windows下面OK，前期工作完成下面以我制作QQ共存版为例：
首先把MobileQQ1_0(Android)_beta2_build0193.apk放到一个空的文件夹里面运行cmd，用cd命令定位到apk所在目录输入：
apktool d MobileQQ1_0(Android)_beta2_build0193.apk QQ <回车>
这个命令，apktool是工具，后面的d是反编译，最后面的QQ是反编译以后的文件放到当前目录的QQ文件夹里面然后会显示
I: Baksmaling…
I: Decoding resource table…
I: Decoding resources…
I: Copying assets and libs…
当软件自动完成了以后，打开Notepad按Ctrl F搜索，选择文件搜索，要把“包含子目录”跟“包含隐藏目录“选上查找目标输入：
Notepad++
com.tencent.qq替换为：com.tencent.q1
文件类型：*.*
目录：反编译以后生成的目录然后点全部替换替换好以后，换另一个关键词查找目标输入：
com/tencent/qq替换为：com/tencent/q1
文件类型：*.*
目录：反编译以后生成的目录然后点全部替换再换查找目标输入：
android.task.qq替换为：android.task.q1
文件类型：*.*
目录：反编译以后生成的目录然后点全部替换OK，全部替换好以后，可以把Notepad关掉了进入QQ文件夹，里面有个smali的文件夹，进去一直进去，会看到有 “gqq2008”“qq”“util”3个文件夹把这里的qq文件夹重命名为q1好，修改完毕了，现在重新编译软件回到CMD，输入：
apktool b QQ <回车>
d是编译的意思，QQ是之前反编译的文件夹编译好以后，到QQ里面的dist文件夹内，会看到一个out.apk的，这个就是我们重新编译好的QQ了当然这个程序还没有签名，我们还要用其他软件签名了以后才能安装上去。